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消化系统由消化管和消化腺两部分组成。消化管包括我们熟知的咽、食管、胃、小肠、大肠。消化腺包括唾液腺、肝和胰。

在消化管和消化腺的表面和内部都有胶原蛋白的存在。在消化系统中常见的疾病有胃炎、胃溃疡、便秘、酒精肝、脂肪肝等。

生物活性肽作用于消化系统可以：

修复炎症部位，保护胃黏膜，抵抗炎症对胃的损害；

调节肠道茵群，有效抑菌、抗炎，修复肠道中的炎症，预防便秘和肠癌；

对酒精引起的肝损伤有保护作用，促进酒精代谢，减轻酒精对肝脏的损伤；

此外，生物活性肽还可以促进脂肪的转运和利用，预防脂肪肝的生成。

骨骼系统包括：骨、骨连结和骨骼肌。在骨骼当中充足的胶原蛋白会链接形成一张网，钙等无机盐附着在胶原纤维上，形成骨骼。在腿部，骨骼链接的膝关节，有关节软骨的存在：在脊椎骨链接的地方有椎间盘的存在，它们的组成都有胶原蛋白的参与，胶原蛋白的流失和减少都可能造成骨骼方面的疾病。

骨骼系统中常见的疾病有骨质疏松、腰椎病、颈椎病、关节炎、股骨头坏死、骨折等等，大都与钙、胶原蛋白的流失有关。

生物活性肽作用于骨骼系统可以促进钙等无机盐的吸收；给胶原蛋白的合成提供原料，为矿物质的沉积提供框架。

激活成骨细胞和破骨细胞的活性，促进骨骼恢复健康，缓解炎症。

免疫系统是人体抵御病原菌侵犯最重要的保卫系统。这个系统由免疫器官、免疫细胞，以及免疫分子所组成。

我们的免疫系统主要是抵抗外来的病原菌的侵害，如果免疫系统去攻击自身正常的器官和组织则会得自身免疫系统疾病，例如红斑狼疮、类风湿性关节炎。如果免疫力低下容易得感冒，受到细菌的感染。

生物活性肽中有一类抗菌肽，它对细菌都有杀灭作用，能起到广谱抗菌作用，从而协助自身免疫系统工作，提高免疫力：生物活性肽还可以激活免疫细胞，促进免疫细胞的增值．从而提高免疫力；

生物活性肽还可以修复系统红斑狼疮造成的皮肤损伤和缓解关节疼痛等症状。

内分泌系统是机体的重要调节系统，它与神经系统相辅相成，共同调节机体的生长发育和各种代谢，维持内环境的稳定，并影响行为和控制生殖等。常见的内分泌疾病有肥胖、糖尿病、痛风、甲亢等疾病。

生物活性肽对于内分泌系统的调节是多样的。例如生物活性肽有促进新陈代谢的作用。

有利于促进脂肪的代谢：痛风是有噤呤代谢异常所引起的，在生活中我们除了控制饮食外，生物活性肽还可以帮助我们溶解尿酸结晶t缓解尿酸盐结晶所致的关节肿、红、胀的情况。

神经系统控制着肌肉的活动，协调各个组织和器官，建立和接受外来情报，并进行协调，所以神经系统是动物体最重要的连络和控制系统。

与神经系统有关的疾病有失眠、老年痴呆、面瘫、等。

在生活活性肽中有类阿片活性肽，它具有镇痛作用，而且不像其他镇痛药一样有副作用，没有依懒性生物活性肽调节睡眠的效果也很显著，对于失眠有很好的调节作用。

生物活性肽还有的抵抗自由基、抗氧化效果，对大脑的神经细胞有很好的保护作用，对于老年痴呆、帕金森综合症有很好的缓解作用。

泌尿系统包括：肾脏、输尿管、膀胱、尿道。女性生殖系统包括：卵巢、输卵管、子宫、和外生殖器等。

男性生殖系统包括：睾丸、附睾、前列腺、尿道等。常见的生殖泌尿疾病有：肾炎、尿道感染、内分泌失调、乳腺疾病等。

生物活性肽具有较强的内分泌调节作用，对内分泌失调引起的疾病如月经不调，乳腺增生等都有很好的调节作用；

在牦牛骨胶原蛋白活肽含有丰富的精氨酸，对促进男性精的生成，提高精运动能量有重要的作用；男性的前列腺主要为结缔组织，结缔组织的主要原料是胶原蛋白，所以补充生物活性肽对前列腺组织十分有益。